מאז המקרה הראשון של מחלת נגיף הקורונה, בדצמבר 2019, התפשטה מחלה מגיפה למיליוני אנשים ברחבי העולם.המגיפה העולמית הזו של הרומןתסמונת נשימתית חריפה חמורה וירוס קורונה 2 (SARS-CoV-2)הוא אחד ממשברי הבריאות העולמיים המרתקים והמדאיגים ביותר של ימינו, המהווה איומים גדולים על העולם ומשפיע על כל ההיבטים של חיי האדם.[1]
וירוסי קורונה הם נגיפי RNA עטופים בעלי חוש חיובי, חד-גדילי במשפחת Coronaviridae, שיש להם קשת רחבה של מארחים כגון בני אדם, עטלפים, גמלים ומינים של עופות, כולל בעלי חיים וחיות לוויה, המהווים איום על בריאות הציבור. 1 נגיף הקורונה מסווג בתת-המשפחה של Orthocoronavirinae, המחולקת עוד יותר לארבעה סוגים, על סמך הבדלים ברצפי החלבונים: a-coronavirus, b-coronavirus, g-coronavirus ו-d-coronavirus.נגיפי a-קורונה ווירוסי b-קורונה מדביקים רק יונקים, ואילו וירוסי g-קורונה ונגיפי d-קורונה מדביקים בעיקר עופות, אם כי חלקם יכולים להדביק יונקים.HCoV-229E,
oV-OC43, HCoV-NL63, HCoV-HKU1, SARSCoV, MERS-CoV ו-SARS-CoV-2 הם שבעת נגיף הקורונה שזוהו כמדביקים בני אדם.ביניהם, SARSCoV ו-MERS-CoV, שהופיעו באוכלוסיית האדם בשנים 2002 ו-2012, הם פתוגניים ביותר.בעוד זני נגיף קורונה אנושי (HCoV)-229E, HCoV-NL63, HCoV-OC43, או HCoV-HKU1 שמסתובבים באוכלוסיית האדם גורמים רק להצטננות,7 תסמונת נשימתית חריפה קשה וירוס קורונה 2 (SARS-CoV2), הגורם הסיבתי של COVID-19, הוא נגיף b-קורונה חדש, שהופיע מוקדם בסוף 2019 והביא למקרי מוות הרסניים.הסימפטומים העיקריים שלCOVID 19דומים לאלה של SARS-CoV ו-MERS-CoV: חום, עייפות, שיעול יבש, כאבים בחזה העליון, לפעמים שלשול וקוצר נשימה.בניגוד לעברזיהומים בקורונה (CoV)., ההפצה הגלובלית המהירה, קצב ההעברה הגבוה, זמן הדגירה הארוך יותר, יותר זיהומים אסימפטומטיים וחומרת המחלה של SARS-CoV-2 דורשים ידע מעמיק לגבי אסטרטגיות ההתחמקות החיסונית הוויראלית.
כמו קורונווירוס אנושיים אחרים (SARS-CoV-2, MERS-CoV), גם ל-SARSCoV-2 יש גנום RNA חד-גדילי בעל חוש חיובי בגודל של כ-30 קילו-בייטים.כפי שמוצג באיור 1, חלבוני הנוקלאוקפסיד הנגיפי (N) כורכים את הגנום לקומפלקס גדול של ריבונוקלאופרוטאין (RNP), אשר עטוף אז על ידי שומנים וחלבונים ויראליים S (ספייק), M (ממברנה) ו-E (מעטפת).לקצה ה-50 של הגנום יש שתי מסגרות קריאה פתוחות גדולות (ORFs), ORF1a ו-ORF1b, המקודדות לפוליפפטידים pp1a ו-pp1b, המיוצרים ל-16 חלבונים לא מבניים (NSPs) הכוללים כל היבט של שכפול ויראלי על ידי פרוטאזות ויראליות NSP3 ו-NSP5 שמכילים תחום פרוטאז דמוי פפאין ותחום פרוטאז דמוי 3C, בהתאמה.9 קצה 30 של הגנום מקודד לחלבונים מבניים ולחלבונים הנלווים, ש-ORF3a, ORF6, ORF7a ו-ORF7b הוכחו כחלבונים מבניים ויראליים המעורבים בהם ביצירת חלקיקים ויראליים ו-ORF3b ו-ORF6 מתפקדים כאנטגוניסטים של אינטרפרון.על פי ההערה הנוכחית על בסיס דמיון רצף לנגיפים אחרים בקורונה, SARS-CoV-2 כולל תחזיות של שישה חלבונים נלווים (3a, 6, 7a, 7b, 8 ו-10).עם זאת, עדיין לא כל ה-ORFs הללו אושרו ניסיוני, והמספר המדויק של הגנים הנלווים של SARS-CoV-2 הוא עדיין נקודת מחלוקת.לכן, עדיין לא ברור אילו גנים נלווים מתבטאים בפועל על ידי הגנום הקומפקטי הזה.[2]
בדיקות רגישות וספציפיות ביותר הן חיוניות לזיהוי ולניהול חולי COVID-19, כמו גם ליישום אמצעי בקרה כדי להגביל את ההתפרצות.לבדיקות מולקולריות של נקודת טיפול (POC) יש פוטנציאל לאפשר זיהוי מוקדם יותר ובידוד 2 של מקרי SARS-CoV-2 מאושרים, בהשוואה לשיטות אבחון מבוססות מעבדה, ובכך להפחית את ההעברה במשק בית ובקהילה.
[1]השפעה קלינית ותפעולית של זיהוי מהיר של SARS-CoV-2 בנקודת טיפול במחלקת חירום
[2] הקרב בין המארח ל-SARS-CoV-2: אסטרטגיות חסינות מולדת ואסטרטגיות התחמקות ויראלית
זמן פרסום: 25 במאי 2022